明治45年（1912）に明治天皇が崩御し、続いて大正3年（1914）に皇后であった昭憲皇太后が亡くなると、明治天皇と昭憲皇太后の遺徳を偲ぶ国民の熱誠により、大正９年11月1日ふたりを祀る神社として明治神宮が創建された。
鎮座地は、明治天皇が「うつせみの 代々木の里は しづかにて 都のほかの ここちこそすれ」と詠んだ代々木の、かつて近江彦根藩井伊家の下屋敷のあった南豊島世伝御料地に造営された。

昭和20年４月（1945）、大東亜戦争の空襲により被災し、創建当初の主要建物は焼失した。
昭和33年11月（1958）、神社建築の粋を集めて復興造営がなされ、現在の社殿が完成した。

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